Ondřej Mucha hat das Orgelspiel am Konservatorium der Evangelischen Akademie in Kroměříž in der Klasse von MgA. Karl Hiner studiert, wo er in 2007 absolviert hat. Das Studium des Orgelspiels hat er im Bereich der Chorleitung der Kirchenmusik an der Universität in Hradec Králové in der Klasse von Dr. František Vaníček und konsultativ bei Prof. Jiří Strejc fortgesetzt. Während des Studiums hat er am Internationalen Interpretationswettbewerb in der Slowakei teilgenommen, wo er den zweiten Preis für Orgelspiel gewonnen hat. Seine fachliche Ausbildung hat er weiter am Internationalen Meisterinterpretationskurz an der Janáček-Akademie für Musik und Darstellende Kunst Brno unter der Leitung von Prof. Kamila Klugarová erweitert. Zurzeit studiert er das Orgelspiel an der Hochschule für Musische Künste Bratislava in der Klasse von Doc. Imrich Szabó, Art.D.

Während seines Studium hat Ondřej Mucha an einer Reihe von Interpretationskursen unter der Leitung von ausländischen Organisten wie z.B. Martin Sander (Deutschland), Susan Landale (Frankreich), Theo Jellema (Holland), Jon Laukvik (Norwegen), Waclaw Golonka (Polen) teilgenommen.

Ondřej Mucha widmet sich der regelmäßigen Konzerttätigkeit sowohl in der Tschechischen Republik als auch im Ausland. In den letzten Jahren hat er sich an mehr als 150 abendfüllenden Orgelkonzerten beteiligt, an denen er solistisch oder zusammen mit der Sopranistin Magdalena Vlasáková aufgetreten ist. Aus seiner umfangreichen Konzerttätigkeit nennen wir z.B. Zyklus von Konzerten zum Jahrestag von MUDr. Celestýn Opitz, der von der Ordnung der barmherzigen Brüder veranstaltet wurde, Zyklus von Konzerten aus dem Werk von Antonín Dvořák, Zyklus von Konzerten zum 60. Todestag des bedeutenden Orgelvirtuosen und Komponisten Prof. Bedřich Antonín Wiedermann, Internationales Orgelfestival Olesnica (Polen), Konzerte von Orgelimprovisation in Verbindung mit Vortrag von geistlichen Texten und vieles mehr.

Neben der Konzerttätigkeit widmet sich Ondřej Mucha als Organist und Komponist auch der Kirchenmusik. Er ist in der Klosterkirche von St. Johannes von Nepomuk in Prostějov, wo er unter anderem auch ein Zyklus von Advent- und Weihnachtskonzerten gegründet hat, weiter in der Kirch von St. Petr und a Pavel und in der Kirche der Erhebung des heiligen Kreuzes tätig. Im Bereich der Komposition widmet er sich insbesondere dem Komponieren von Liedern und kleineren Chorkompositionen.

Nicht zuletzt widmet sich Ondřej Mucha auch der pädagogischen Tätigkeit. Er unterrichtet das Orgelspiel am Bischofsgymasium von Bohuslav Balbín in Hradec Králové und hält Vorlesungen auf das Thema liturgische Musik, Orgelspiel und Orgelimprovisation am Kurs für Organisten beim Gymnasium von Kyrill und Method in Prostějov. In 2012 wurde Ondřej Mucha im Rahmen des Orgelwettbewerbs ORGANUM REGIUM mit dem Preis für die ausgezeichnete pädagogische Leitung im Bereich der Orgelpädagogig ausgezeichnet.